操作日本海外仓一件代发通常需要按照以下步骤进行：
1. 选择日本海外仓服务商：根据海外仓服务商的实力、仓储硬件、资质等因素，选择合适的日本海外仓服务商。
2. 货物运输到日本海外仓：与日本海外仓进行沟通，并安排货物运输到海外仓。可以选择海外仓提供的头程运输服务，或自行寻找专线通过空运或海运将货物运输到日本海外仓。
3. 货物入仓上架：货物抵达日本海外仓后，仓库人员会进行入仓、检验和上架等操作。卖家可以在自己的店铺上架产品进行销售。
4. 货物配送：如果有买家下单，卖家需要上传订单，日本海外仓根据订单指令进行货物的分拣和派送。通常会安排当地的快递或卡车等方式进行配送。买家收到货物后进行签收，完成一件代发流程。
5. 收费标准：日本海外仓的收费标准因服务商而异。有些海外仓可能只有几项明确的收费，如头程运输费、贴标费、出库费和仓储费。而有些海外仓可能有多达二十多项的收费，需要注意隐藏的收费项目。在收到海外仓报价表时，要仔细阅读并确保清楚收费标准。
请注意，每家日本海外仓的操作流程和收费标准可能有所不同，因此在选择海外仓服务商之前，建议与他们进行详细的沟通和了解，确保清楚整个操作流程和相关费用。
