1.选择范围的差异：
亚马逊日本FBA仓库对所选产品的尺寸、重量和品类有一定的限制，选择体积小、利润高、质量好的产品；第三方海外仓比日本FBA仓的选择范围更广，也适用于体积和重量较大的产品。
2.头程服务的差异：
亚马逊日本FBA仓库不会向卖方提供首次清关服务；第三方海外仓储服务商会将为卖家提供第一时间的通关服务，甚至包括纳税和送货到仓库的一站式服务。
3.产品入库前要求的差异
亚马逊的日本FBA仓库有严格的仓储要求。卖方须在装运前附上外箱标签和产品标签。若外箱或产品标签损坏，卖方需在进入日本FBA仓库前进行整理。亚马逊不提供产品组装服务；第三方海外仓库的仓储要求没有亚马逊日本FBA仓库严格。
4.入库后产品分布差异
默认情况下，亚马逊的仓库是分开的，卖家的产品经常被分配到不同的仓库进行混合存储；第三方海外仓库一般将货物放在同一仓库集中管理。
