日本FBA物流在特殊情况下处理货物时，涉及到几个方面的具体操作：
1. 进口货物的分波、分运和变更运输方式处理：
分波、分运和变更运输方式处理：当收货人将不同收货人的货物按一份运单发运时，代理行为人在中国国境站接收信息后，会根据要求进行分波、拆箱和中转服务管理业务，并根据发货人或收货人的要求改变运输方式，例如从海运转为空运或反之。
办理转船要求：在办理转船时，货物的包装必须符合运输要求，单件货物必须一致，并完成清关手续。
2. 出口货物的变更和安排：
出口企业货物贸易情况的变更：当出口企业货物贸易出现问题时，需要及时得到有效信息进行研究分析数据整理或换装，以确保货物顺利出口。
不符合技术要求的车辆：如果使用的车辆不符合技术要求，必须更换原车型或标准重型车辆。
3. 处理事故货物：
货物到达边防站时的处理：如果货物在边防站出现资源短缺、损坏、盗窃等情况，由铁路企业负责边防站的维修，承担管理费用。
发货造成的事故：如果事故是因发货造成的，经纪人需要负责全面整修，并承担社会一切管理费用和损失。
无法维修的货物处理：如果由于信息技术的发展无法进行维修，托运人应前往边防站指导或将货物退回托运人处理。
4. 对车辆的处理：
整车出口技术条件的要求：整车出口的技术条件必须符合要求，否则不能离开。
进口车辆的处理：进口车辆在中国国境站卸车后，应立即进行空车处理，必要时需要进行清洗和消毒。
以上就是日本FBA物流在特殊情况下处理货物时的一些具体操作和要求。
